Co-infection of SARS-CoV-2 and dengue virus: a clinical challenge

Abstract Many regions of the world where dengue epidemics are seasonal are also facing the COVID-19 pandemic. This is a medical concern because both diseases are difficult to distinguish since they have similar clinical symptoms and laboratory findings, and because they have different clinical management. So far, co-infection of SARS-CoV-2 and dengue virus (DENV) has not been studied. Herein we report the first case of a patient with co-infection of COVID-19 and dengue. Both infections were simultaneously laboratory confirmed by positive RT-qPCR for SARS-CoV-2 and RT-qPCR for DENV, NS1, IgM and IgG antibody tests for dengue. The patient had a favorable clinical improvement, without severe symptoms. This case emphasize that, in pandemic era, having a diagnostic of one infection does not rule out the possibility of having another infection concomitantly. In addition, underscores the importance of an accurate and timely diagnosis to prevent the spread of COVID-19.

Prevalence of the rs1801282 single nucleotide polymorphism of the PPARG gene in patients with metabolic syndrome

Objective This study aimed to get the genotypic and allelic frequencies of rs1801282 in 179 volunteer donors and 154 patients with Metabolic syndrome (MetS) in Brasilia, Brazil and also examine the association with anthropometric, biochemical and hemodynamic variables in the latter group. MetS comprises a group of diseases resulting from insulin resistance, in-creased risk of type 2 diabetes and atherosclerotic cardiovascular disease. MetS is defined by the presence of increased visceral fat, atherogenic dyslipidemia (elevated triglycerides (TGL)), with decreased high density lipoprotein (HDL) and increased low density lipoprotein (LDL) levels, hypertension (BPH) and disturbances in glucose homeostasis representing a significant burden across the world due to the alarming increase in the incidence over the last decades besides their significant morbidity and mortality. Peroxisome proliferator activated receptor-gamma (PPARg) has been mentioned as a candidate gene for determining the risk of MetS. It is a member of the nuclear receptors superfamily and a ligand-activated transcription factor, which regulates the expression of genes involved in the network lipogenesis and adipogenesis, insulin sensitivity, energy balance, inflammation, angiogenesis and atherosclerosis. Among the PPARG genetic variants, single nucleotide polymorphism rs1801282 has been the most extensively studied one since it was first described by Yen and cols. in 1997. This polymorphism is characterized by the replacement of a proline (CCC) to an alanine (GCA) at codon 12 of exon B, due to the exchange of a cytosine with a guanine. The Ala allele frequency varies in different ethnic groups.Materials and methods DNA was extracted using Chelex-100 method and determinations of genotypes were performed by allele-specific chain reaction.Results The distribution of genotype frequency of the MetS group was not statistically different from the frequency in the donor population at large. In the first group, genotype frequency was CC to 0.869 and 0.103 for CG, while allelic frequencies were 0.948 for C and 0.052 for G allele. In the group of donors, the genotype and allele frequencies were 0.882 for CC, 0.117 to CG; and 0.941 to 0.059 for G and C, respectively. GG genotype was not found in any of the two groups. The genotype distribution and allele frequencies were in Hardy-Weinberg equilibrium. No marker could be detected from the analysis of anthropometric, biochemical and hemodynamic variables in the MetS group.Conclusion Our data suggest that this polymorphism is not correlated with predisposition to MetS. The results obtained on a small sample of the population of Brasilia, corroborate the data reported in the literature on the prevalence of this polymorphism in PPAR in populations of different ethnic origins.

Association of the rs7903146 single nucleotide polymorphism at the Transcription Factor 7-like 2 (TCF7L2) locus with type 2 diabetes in Brazilian subjects / Associação do polimorfismo de nucleotídeo único rs7903146 no locus do TCF7L2 com diabetes tipo 2 em indivíduos brasileiros

OBJECTIVE:To investigate the association of the T allele of the single nucleotide polymorphism (SNP) rs7903146 of TCF7L2 with the occurrence of T2D in a sample of subjects followed up at the Brasilia University Hospital. SUBJECTS AND METHODS: The SNP rs7903146 of TCF7L2 was genotyped by allele-specific PCR in 113 patients with known T2D and in 139 non-diabetic controls in Brasilia, Brazil. RESULTS:We found that the T allele of the SNP rs7903146 of TCF7L2 was significantly associated with T2D risk (odds ratio of 3.92 for genotype TT in the recessive genetic model, p = 0.004 and 1.5 for T allele, p = 0.032). CONCLUSION:These results reinforce previous findings on the consistent association of this genetic factor and the risk of T2D in populations of diverse ethnic backgrounds. Arq Bras Endocrinol Metab. 2012;56(8):479-84.

OBJETIVO: Investigar a associação do alelo T do polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) rs7903146 do TCF7L2 com a ocorrência de DM2 em uma amostra de indivíduos acompanhados no Hospital Universitário de Brasília. SUJEITOS E MÉTODOS: O SNP 7903146 do TCF7L2 foi genotipado por PCR alelo-específica em 113 pacientes portadores de DM2 e em 139 controles não diabéticos em Brasília, Brasil. RESULTADOS: Foi observada associação significativa do alelo T do SNP rs7903146 do TCF7L2 com a ocorrência de DM2 (razão de chances de 3,92 para o genótipo TT utilizando o modelo genético recessivo, p = 0,003; e de 1,5 para o alelo T, p = 0,032). CONCLUSÃO: Esse resultado reforça os achados prévios de associação consistente desse fator genético com o risco de diabetes em populações de origens étnicas diversas. Arq Bras Endocrinol Metab. 2012;56(8):479-84.

Ausência de associação entre o genótipo CC do polimorfismo rs7903146 no gene TCF7L2 e artrite reumatoide / Lack of association between the CC genotype of the rs7903146 polymorphism in the TCF7L2 gene and rheumatoid arthritis

INTRODUÇÃO: TCF7L2 é um fator de transcrição envolvido na sinalização Wnt/beta-catenina e tem uma variante conhecida por associar-se consistentemente com o risco de diabetes tipo 2. Alguns estudos também relataram sua associação com o risco de alguns tipos de câncer. OBJETIVO: Como essa via pode também estar envolvida na fisiopatologia de outras doenças inflamatórias crônicas, tais como artrite reumatoide, o objetivo deste estudo foi investigar o efeito do polimorfismo rs7903146 do gene TCF7L2 na gravidade da artrite reumatoide em uma população brasileira. PACIENTES E MÉTODOS: Esse polimorfismo foi genotipado em 208 pacientes com artrite reumatoide e em 104 controles saudáveis. Analisou-se também a associação desse polimorfismo com história de tabagismo, classe funcional e indicadores radiológicos de gravidade da doença. RESULTADOS: A distribuição dos genótipos CC, CT e TT do polimorfismo rs7903146 do gene TCF7L2 não diferiu entre pacientes e controles, nem se encontrou qualquer associação entre o genótipo e os indicadores de gravidade da doença ou história de tabagismo. Quando os dados foram avaliados usando-se o modelo dominante, no qual portadores dos genótipos CT e TT foram agrupados, observou-se um aumento do alelo T em pacientes com fator reumatoide positivo e erosões, embora não significativo. A frequência do alelo T também estava aumentada nos pacientes com classe funcional II quando comparados àqueles com classe I (P = 0,032). CONCLUSÃO: É possível que o pequeno número de pacientes incluído neste estudo tenha dificultado achados adicionais. Outros estudos são, portanto, necessários para que se investigue o papel das variantes do gene TCF7L2 no risco de artrite reumatoide e sua gravidade.

INTRODUCTION: TCF7L2 is a transcription factor involved in Wnt/beta-catenin signaling and which has a variant known to be consistently associated with type 2 diabetes risk and some studies have also indicated its association with risk of certain types of cancer. OBJECTIVE: Since this pathway may be involved in the pathophysiology of other chronic inflammatory diseases such as rheumatoid arthritis, we aimed to investigate the effect of TCF7L2 polymorphism rs7903146 on rheumatoid arthritis severity in a Brazilian population. PATIENTS AND METHODS: This polymorphism was genotyped in 208 patients with rheumatoid arthritis and in 104 healthy controls. We also analyzed the association of this polymorphism to smoking history, functional status classification and radiological indicators of disease severity. RESULTS: The distribution of CC, CT and TT genotypes of SNP rs7903146 of the TCF7L2 gene was not different between patients and controls, and no association between the genotype and indicators of disease severity or smoking history was found. When data were evaluated using the dominant model, in which carriers of the CT and TT genotypes were grouped, an increase in the T allele was observed in patients positive for rheumatoid factor and erosions, although this was not significant. The frequency of T allele was also increased in patients with functional class II compared to class I (P = 0.032). CONCLUSION: It is possible that the small number of patients included in this study may have restrained additional findings. Further studies are therefore needed to investigate the role of TCF7L2 gene variants in the risk of rheumatoid arthritis and its severity.

Diagnóstico molecular – passado, presente e futuro / Molecular diagnosis – past, present and future

Este artigo consiste em uma descrição dos fatos históricos relacionados ao diagnóstico molecular, das técnicas disponíveis e do que se espera para o futuro do setor. Inicialmente, foram abordados as descobertas e os avanços originados dentro dos laboratórios de pesquisa das universidades, onde, efetivamente, nasceram as técnicas de análise de ácidos nucleicos. Posteriormente foi descrita a evolução que estas técnicas vêm sofrendo ao longo do tempo até se chegar ao formato atual, passando pela biologiamolecular manual e automatizada, abrangendo, basicamente, a PCR e a PCR tempo real. Além disso, foram discutidas e descritas brevemente outras técnicas de amplificação de ácidos nucleicos, amplificação de sinal e microarranjos. Por fim, foi apresentado um resumo das principais expectativas em relação ao diagnóstico molecular, considerando seu crescimento, o mercado de análises clínicas e as novas áreas e abordagens.

This article is a description of historical events related to molecular diagnosis, the techniques used today, and what thehope for the future of this segment is. First, we turn back to discoveries and advances originated within the research laboratory inside the universities, where the nucleic acid analysis techniques were born and we describe the progress that they have suffered until the current format. Otherwise, this is a brief history from manual molecular biology to automated molecular biology coveringmainly PCR, real time PCR. Moreover, we discuss briefly about other techniques for nucleic acid amplification, signal amplification and microarrays. Finally, we make a summary of the main expectations for the molecular diagnosis covering growth, market, new areas and approaches.

Avaliação da influência do polimorfismo do códon 16 do receptor beta-2 adrenérgico na incidência de hipotensão arterial e uso de efedrina em grávidas submetidas à anestesia subaracnoidea / Evaluation of the influence of the codon 16 polymorphism of the beta-2 adrenergic receptor gene on the incidence of arterial hypotension and ephedrine use in pregnant patients submitted to subarachnoid anesthesia

JUSTIFICATIVA E OBJETIVOS: O gene do receptor beta-2 adrenérgico possui diversos polimorfismos. Estudos recentes vêm demonstrando sua importância clínica. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência do polimorfismo Arg16Gli na incidência de hipotensão arterial e uso de efedrina em parturientes submetidas ao bloqueio subaracnoideo para cesariana. MÉTODO: Parturientes hígidas (ASA I e II) foram submetidas à anestesia raquidiana para realização de cesariana eletiva (n = 50). Efedrina foi administrada nos casos de hipotensão arterial. A incidência de hipotensão arterial e a dose requerida de efedrina para correção da pressão arterial foram comparadas entre os diferentes genótipos encontrados. RESULTADOS: O genótipo mais prevalente foi o Arg16Gli (60 por cento, n = 30) seguido pelo Gli16Gli (26 por cento, n = 13) e Arg16Arg (14 por cento, n = 7). Não foram observadas diferenças entre as características básicas dos genótipos. Com relação ao genótipo Arg16Arg, o Gli16Gli apresentou aumento da razão de risco de hipotensão arterial (hazard ratio) de 3,95 vezes (IC 95 por cento 0,86-18,11; p = 0,076), enquanto o Arg16Gli apresentou aumento de 4,83 vezes (IC 95 por cento 1,13-20,50; p = 0,033). As parturientes com Arg16Arg precisaram, em média, de 6,4 ± 8,5 mg de efedrina para correção de hipotensão arterial, enquanto as do Arg16Gli precisaram de 19,5 ± 15,9 mg (p = 0,0445; IC 95 por cento 0,3325-25,78) e as do tipo Gli16Gli, 19,2 ± 14,3 (p = 0,0445, IC 95 por cento 0,3476-25,26). CONCLUSÕES: Os resultados mostraram que a variante genética Arg16Arg apresenta menor incidência de hipotensão arterial e que menores doses de efedrina foram necessárias para restabelecimento de normotensão arterial nas pacientes com esse perfil genético. Concluímos que o genótipo Arg16Arg confere maior estabilidade pressórica às parturientes submetidas à anestesia raquidiana para cesariana.

BACKGROUND AND OBJECTIVES: The beta-2 adrenergic receptor gene has several polymorphisms. Recent studies have demonstrated the clinical importance of the latter. The objective of the present study was to evaluate the influence of the Arg16Gli polymorphism on the incidence of arterial hypotension and ephedrine use in pregnant patients submitted to subarachnoid block for Cesarean section. METHOD: Healthy parturients (ASA I and II) were submitted to subarachnoid anesthesia for elective Cesarean section (n = 50). Ephedrine was administered in cases of arterial hypotension. The incidence of arterial hypotension and the required dose of ephedrine to correct the arterial pressure were compared between the different genotypes identified. RESULTS: The most prevalent genotype was Arg16Gli (60 percent, n = 30) followed by Gli16Gli (26 percent, n = 13) and Arg16Arg (14 percent, n = 7). No differences were observed regarding the basic characteristics of the genotypes. In comparison to the Arg16Arg genotype, the Gli16Gli presented a 3.95-fold increase in the hazard ratio of arterial hypotension (95 percentCI 0.86-18.11; p = 0.076), whereas the Arg16Gli presented a 4.83-fold increase (95 percentCI 1.13-20.50; p = 0.033). The parturients with the Arg16Arg needed, on average, 6.4 ± 8.5 mg of ephedrine to correct the arterial hypotension, whereas those with the Arg16Gli needed 19.5 ± 15.9 mg (p = 0.0445; 95 percentCI 0.3325-25.78) and the ones with the Gli16Gli genotype, 19.2 ± 14.3 (p = 0.0445, 95 percentCI 0.3476-25.26). CONCLUSIONS: The results show that the genetic variant Arg16Arg presents a lower incidence of arterial hypertension and that lower doses of ephedrine were necessary to reestablish normal arterial pressure in the patients with this genetic profile. We conclude that the Arg16Arg genotype confers better pressure stability to the parturients submitted to subarachnoid anesthesia for Cesarean section.

JUSTIFICATIVA Y OBJETIVOS: El gen del receptor beta-2 adrenérgico posee diversos polimorfismos. Estudios recientes han venido demostrando su importancia clínica. El objetivo de este trabajo, fue evaluar la influencia del polimorfismo Arg16Gli en la incidencia de hipotensión arterial y el uso de efedrina en parturientas sometidas al bloqueo subaracnoideo para cesárea. MÉTODO: Parturientas sanas (ASA I y II) fueron sometidas a la anestesia raquídea para la realización de cesárea electiva (n = 50). Efedrina fue administrada en los casos de hipotensión arterial. La incidencia de hipotensión arterial y la dosis requerida de efedrina para la corrección de la presión arterial fueron comparadas entre los diferentes genotipos encontrados. RESULTADOS: El genotipo que más prevaleció fue el Arg16Gli (60 por ciento, n = 30) seguido por el Gli16Gli (26 por ciento, n = 13) y Arg16Arg (14 por ciento, n = 7). No se observaron diferencias entre las características básicas de los genotipos. Con relación al genotipo Arg16Arg, el genotipo Gli16Gli presentó un aumento de la razón de riesgo de hipotensión arterial (hazard ratio) de 3,95 veces (IC 95 por ciento 0,86-18,11; p = 0,076), mientras que el genotipo Arg16Gli presentó un aumento de 4,83 veces (IC 95 por ciento 1,13-20,50; p = 0,033). Las parturientas con genotipo Arg16Arg, necesitaron como promedio 6,4 ± 8,5 mg de efedrina para la corrección de la hipotensión arterial, mientras que las del genotipo Arg16Gli necesitaron 19,5 ± 15,9 mg (p = 0,0445; IC 95 por ciento 0.3325-25.78) y las del tipo Gli16Gli 19,2 ± 14,3 (p = 0,0445, IC 95 por ciento 0.3476-25.26). CONCLUSIONES: Los resultados mostraron que la variante genética Arg16Arg presenta una menor incidencia de hipotensión arterial y que menores dosis de efedrina fueron necesarias para el reestablecimiento de la normotensión arterial en las pacientes con ese perfil genético. Concluimos que el genotipo Arg16Arg le da una mayor estabilidad de presión a...

A novel mutation of thyroid hormone receptor beta (I431V) impairs corepressor release, and induces thyroid hormone resistance syndrome / Uma nova mutação no TR beta (I431V) prejudica a liberação de correpressores e induz síndrome de resistência ao hormônio tireoideano

Resistance to thyroid hormone (RTH) is a rare disorder characterized by variable tissue hyporesponsiveness to thyroid hormone, usually caused by mutations in the thyroid hormone receptor beta (TRβ). We describe a large Brazilian family harboring a novel mutation affecting TRβ gene and inducing RTH. A 14-year-old girl was found to have elevated free T4 and free T3 plasma concentrations in coexistence with unsuppressed TSH and a questionable goiter. The diagnosis of RTH was verified by identification of a novel mutation (I431V) in the TRβ gene. Sixteen asymptomatic relatives of the proposita are also affected by the mutation. Functional studies showed that I431V mutation exerts dominant-negative effect on wild type TRβ, mainly by impairment of ligand-dependent release of corepressor SMRT. The presence of this mutation reduces potency, but does not affect efficacy of thyroid hormone action, in accordance with the clinical picture of eumetabolism of the affected individuals.

A resistência ao hormônio tireoideano (RHT) é uma doença rara, causada por variável hiporresponsividade dos tecidos aos hormônios tireoideanos, usualmente causada por mutações no receptor beta do hormônio tireoideano (TRβ). Descrevemos uma grande família brasileira portadora de uma nova mutação afetando o gene do TRβ, induzindo RHT. Uma paciente de 14 anos de idade apresentou concentrações plasmáticas elevadas de T4 e T3 livres, associadas a TSH não-suprimido e bócio questionável. O diagnóstico de RHT foi estabelecido pela identificação da mutação I431V no gene do TRβ. Dezesseis parentes assintomáticos da probanda também são afetados pela mutação. Estudos funcionais mostram que a mutação I431V exerce efeito dominante negativo sobre o TR selvagem, basicamente, por prejudicar a liberação do correpressor SMRT ligante-dependente. A presença desta mutação reduz a potência, mas não afeta a eficácia da ação do hormônio tireoideano, o que está de acordo com a apresentação clínica de eumetabolismo dos indivíduos afetados.

Allele-specific PCR assay to genotype SNP rs7903146 in TCF7L2 gene for rapid screening of diabetes susceptibility / Ensaio de PCR alelo-específico para genotipar o SNP rs7903146 no gene TCF7L2 para rápida triagem de suscetibilidade ao diabetes

OBJECTIVE: The aim of the present study is to validate a rapid and simple allele-specific PCR that genotypes TCF7/L2 rs7903146 (C/T) polymorphism with standard PCR instruments. METHODS: Two forward primers with variations in their 3' nucleotides were designed in such a way that each was specific for one of the two variants. They were combined with a common reverse primer into two PCR reactions. Specific amplification indicates the presence of the allele. One hundred and four DNA samples were genotyped by this method. To evaluate the assay, the polymorphism spanning region of 63 DNA samples representing the three possible genotypes was sequenced. RESULTS: The rs7903146 allele assignments derived from the allele-specific PCR were in complete agreement with sequencing. CONCLUSIONS: The assay described here is a suitable strategy for the TCF7/L2 rs7903146 (C/T) genotyping also allowing rapid and reliable identification.

OBJETIVO: O objetivo deste estudo foi validar um método de PCR alelo-específico, rápido e simples, para genotipagem do polimorfismo rs7903146 (C/T) no gene TCF7/L2 utilizando equipamentos convencionais. MÉTODOS: Dois primers forward com variações nos seus nucleotídeos 3' foram desenhados de forma que cada um fosse específico para uma das variantes. Eles foram combinados com um primer reverso comum em duas reações de PCR. A amplificação de tamanho específico indica a presença do alelo. Cento e quatro amostras de DNA foram genotipadas por esse método. Para validar o ensaio, uma amostragem representativa dos três possíveis genótipos (63 amostras) teve a região contendo o polimorfismo seqüenciada. RESULTADOS: A genotipagem do polimorfismo rs7903146 derivada da PCR alelo-específica estava em completa concordância com o sequenciamento. CONCLUSÕES: O ensaio aqui descrito é uma estratégia adequada para a genotipagem do polimorfismo rs7903146 (C/T) do gene TCF7/L2 e permite identificação alélica rápida e precisa.

Genética do diabetes mellitus do tipo 2: novidades e perspectivas / Genetics of type 2 diabetes mellitus: news and perspectives

O diabetes mellitus do tipo 2 representa um grupo heterogêneo de distúrbios metabólicos que compartilha a hiperglicemia. Fatores ambientais são considerados os principais determinantes do aumento global de sua prevalência. Entretanto, a suscetibilidade à doença é reconhecidamente o resultado de fatores genéticos complexos, e a identificação de variantes genéticas relacionadas ao diabetes tipo 2 tem sido um dos principais focos de pesquisa em diabetes relacionada à doença. Progressos em epidemiologia genética, em especial a viabilização dos estudos de mapeamento global do genoma, vêm contribuindo para isso. Esses estudos identificaram diversas variantes genéticas de suscetibilidade ao diabetes em questão, cujo impacto sobre o metabolismo humano normal e sobre a fisiopatologia dessa morbidade precisa ainda ser elucidado. Embora muito ainda tenha de ser compreendido para que essas informações tragam benefícios à prática clínica, esses conhecimentos representam novas perspectivas para o aprimoramento de abordagens preventivas e terapêuticas e para melhor compreensão da interação entre fatores genéticos e ambientais implicadas no desenvolvimento do diabetes mellitus do tipo 2.

Type 2 diabetes is a heterogeneous group of metabolic disorders sharing hyperglycemia. Environment and life style changes have a primary role in the current epidemic of this illness worldwide, but the inherent susceptibility to the disease is widely attributed to complex genetic factors. The identification of genetic variants influencing the type 2 diabetes is a major focus of research to improve understanding of the mechanisms underlying its pathogenesis. Advances in genetic epidemiology, in particular genome-wide association studies, have significantly contributed tothis. These studies identified many genetic variants associated with type 2 diabetes, whose impact on normal human metabolism and on disease should still be elucidated. Although there is a lot to be understood before genetic information can be translated into benefits in clinical practice, this knowledge brings new perspectives to the development of improved preventative and therapeutic strategies, and to better understanding gene-environment interactions implicated in type 2 diabetes.